平凡だが廃墟マニアの少年、千川つとむは廃ビル探索中幼馴染の早宮夏美について来られ、土煙の中から現れた化物に襲われ、咄嗟に早宮をかばって投げ飛ばされた…という夢を見た…と思った…。

　ジェットコースターに乗っているような悪夢から目覚めたつとむは、全裸だった。一瞬で制服姿になったり見知らぬ女の姿になったり虫が謝辞を述べたりする状況に怒りを露にすると見せられたのは自分の死体だった！

　つとむの肉体修復許可が下り、バーディーは故郷へ戻る。裁判の証人として出廷した彼女は窮地に立たされた。救いの手を差し伸べたのは、つとむだった…。

　級友・中杉小夜香全快パーティに誘われたものの、バーディーの用事で遅れたつとむ。彼女の助言で花束を持って行き、小夜香に心ときめかせる…。

　廃墟倶楽部プロモーションビデオ制作の為つとむ達は小夜香の別荘がある沢尻村を訪れた。楽しいひと時を過ごした翌日、惨劇が起きていた…。

　沢尻村から戻って来た小夜香が沈んでいる。彼女の祖父から相談され、つとむは彼女を誘った…。

　自分の肉体を取り戻したつとむ。ところが内情を知り過ぎた為に東京が、級友が危機に晒されている事を悟る。級友を救う為、彼は、走る！

　東京壊滅の危機が去り、新たな任務指令がくるまでの間にあった話。